Nejúčinnějším a nejčastěji používaným dezinfekčním prostředkem je chlor, který se k dezinfekci vody používá již více než 200 let. Pouze chlor může být lepší než chlor. Chlor má dobré oxidační vlastnosti a je velmi účinný při dekontaminaci patogenů: poskytuje maximální ochranu proti plísním, řasám a choroboplodným bakteriím. A při správném dávkování chlóru jsou jeho zápach a přítomnost pro lidi v bazénu neznatelné a nepostřehnutelné.
Podle norem musí mít voda v bazénu kvalitu pitné vody. To znamená, že při správném dávkování všech chemických látek je voda v bazénu v podstatě pitnou vodou. Není tedy třeba se obávat dávkování chemikálií v bazénové vodě, ale měli byste si dát pozor na špinavou, nedezinfikovanou vodu.
Dezinfekce chlorem je navíc cenově nejdostupnější.