Najúčinnejším a najčastejšie používaným dezinfekčným prostriedkom je chlór, ktorý sa na dezinfekciu vody používa už viac ako 200 rokov. Iba chlór môže byť lepší ako chlór. Chlór má dobré oxidačné vlastnosti a je veľmi účinný pri dekontaminácii patogénov: poskytuje maximálnu ochranu proti plesniam, riasam a patogénnym baktériám. A keď sa chlór správne dávkuje, jeho zápach a prítomnosť sú pre ľudí v bazéne nepostrehnuteľné a nevnímateľné.
Podľa noriem musí mať bazénová voda kvalitu pitnej vody. To znamená, že pri správnom dávkovaní všetkých chemikálií je bazénová voda v podstate pitnou vodou. Dávkovania chemikálií v bazénovej vode sa teda nemusíte obávať, ale mali by ste si dať pozor na špinavú, nedezinfikovanú vodu.Okrem toho je dezinfekcia chlórom cenovo najdostupnejšia.